papimi-hoidot ovat yleensä erittäin hyvin siedettyjä.
Koska papimilla on elimistöä säätelevä vaikutus, on odotettavissa positiivisia ”sivuvaikutuksia” (kipuoireet, verenkuva, aineenvaihdunta). Siitä huolimatta sivuvaikutuksia voi esiintyä pienellä osalla potilaista. 1,5 % potilaista valitti huimausta, väsymystä, pahoinvointia tai päänsärkyä ensimmäisen hoidon aikana. Hoidon onnistuminen paranee ja nämä alkureaktiot vähenevät juomalla riittävästi vettä ennen ja jälkeen hoidon. Muutamilla potilailla oireiden voimakkuus voi lisääntyä lyhytaikaisesti. Fysioterapian jälkeisen tilapäisen kivun lisääntymisen vaikutus tunnetaan fysioterapian alalla ja viittaa akuuttiin vaikutukseen. Alkuperäinen kivun lisääntyminen vähenee yleensä muutaman päivän kuluttua.
Sähkömagneettisten hoitojen tunnetut vasta-aiheet ovat: elektroniset implantit, kuten sydämentahdistimet tai sisäkorvaistutteet, metalliset renkaan muotoiset implantit ja raskaus.
Applikaattorin välittömässä läheisyydessä ei saa olla elektronisia esineitä. Pidä nämä vähintään 2 metrin päässä applikaattorista.